Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms