Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BACE1P56817 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BACE1P56817 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BACE1P56817 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BACE1P56817 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BACE1P56817 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BACE1P56817 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BACE1P56817 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BACE1P56817 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BACE1P56817 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BACE1P56817 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BACE1P56817 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BACE1P56817 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BACE1P56817 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BACE1P56817 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BACE1P56817 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BACE1P56817 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BACE1P56817 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BACE1P56817 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BACE1P56817 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms