Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN17P56750 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms