Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPD52P55327 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPD52P55327 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPD52P55327 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPD52P55327 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPD52P55327 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPD52P55327 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPD52P55327 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TPD52P55327 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms