Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms