Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGDP52209 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms