Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLMP48507 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLMP48507 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCLMP48507 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms