Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM5CP41229 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms