Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms