Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms