Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA3P35244 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA3P35244 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA3P35244 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA3P35244 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA3P35244 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA3P35244 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA3P35244 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA3P35244 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA3P35244 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA3P35244 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA3P35244 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA3P35244 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA3P35244 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA3P35244 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA3P35244 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPA3P35244 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPA3P35244 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPA3P35244 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPA3P35244 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPA3P35244 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPA3P35244 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPA3P35244 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPA3P35244 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPA3P35244 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPA3P35244 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPA3P35244 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPA3P35244 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPA3P35244 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA3P35244 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms