Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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CASQ1P31415 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CASQ1P31415 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CASQ1P31415 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CASQ1P31415 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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