Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms