Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms