Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPREP23469 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPREP23469 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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