Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms