Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MATN1P21941 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MATN1P21941 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MATN1P21941 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MATN1P21941 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MATN1P21941 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MATN1P21941 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MATN1P21941 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MATN1P21941 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MATN1P21941 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MATN1P21941 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MATN1P21941 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MATN1P21941 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MATN1P21941 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MATN1P21941 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MATN1P21941 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms