Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

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Length 2,839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NF1P21359 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NF1P21359 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NF1P21359 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NF1P21359 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NF1P21359 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NF1P21359 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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NF1P21359 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NF1P21359 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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NF1P21359 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NF1P21359 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NF1P21359 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NF1P21359 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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NF1P21359 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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NF1P21359 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NF1P21359 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NF1P21359 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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NF1P21359 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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NF1P21359 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NF1P21359 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NF1P21359 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NF1P21359 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NF1P21359 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NF1P21359 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NF1P21359 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NF1P21359 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NF1P21359 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NF1P21359 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NF1P21359 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NF1P21359 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NF1P21359 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NF1P21359 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NF1P21359 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NF1P21359 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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