Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHCEP18577 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHCEP18577 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHCEP18577 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHCEP18577 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHCEP18577 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHCEP18577 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHCEP18577 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHCEP18577 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHCEP18577 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHCEP18577 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHCEP18577 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHCEP18577 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHCEP18577 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHCEP18577 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHCEP18577 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHCEP18577 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHCEP18577 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHCEP18577 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHCEP18577 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHCEP18577 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHCEP18577 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHCEP18577 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHCEP18577 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHCEP18577 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHCEP18577 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms