Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT1P13805 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms