Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms