Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms