Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GLI4P10075 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GLI4P10075 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GLI4P10075 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GLI4P10075 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms