Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC192P0DO97 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms