Protein–RNA interactions for Protein: P07202

TPO, Thyroid peroxidase, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPOP07202 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPOP07202 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPOP07202 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPOP07202 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPOP07202 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPOP07202 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPOP07202 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPOP07202 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPOP07202 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPOP07202 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPOP07202 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPOP07202 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPOP07202 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPOP07202 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPOP07202 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPOP07202 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPOP07202 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPOP07202 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPOP07202 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPOP07202 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPOP07202 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPOP07202 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPOP07202 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPOP07202 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms