Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOA4P06727 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOA4P06727 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOA4P06727 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOA4P06727 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOA4P06727 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOA4P06727 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOA4P06727 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOA4P06727 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOA4P06727 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOA4P06727 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOA4P06727 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOA4P06727 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOA4P06727 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOA4P06727 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOA4P06727 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA4P06727 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA4P06727 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA4P06727 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA4P06727 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA4P06727 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA4P06727 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA4P06727 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA4P06727 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA4P06727 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA4P06727 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA4P06727 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA4P06727 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA4P06727 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOA4P06727 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms