Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms