Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms