Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRPO00591 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms