Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms