Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms