Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DXG7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DXG7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms