Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DGG1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DGG1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DGG1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DGG1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DGG1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DGG1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DGG1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DGG1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DGG1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DGG1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DGG1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DGG1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DGG1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DGG1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DGG1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DGG1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DGG1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DGG1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DGG1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DGG1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DGG1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DGG1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DGG1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DGG1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DGG1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DGG1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DGG1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DGG1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DGG1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms