Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGPD3A6NKT7 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms