Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms