Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R0

GRIP1, Glutamate receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP1Q9Y3R0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIP1Q9Y3R0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms