Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQM7

CAMK2A, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2AQ9UQM7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAMK2AQ9UQM7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAMK2AQ9UQM7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms