Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms