Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms