Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms