Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms