Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
XCL2Q9UBD3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms