Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKIRAS1Q9NYS0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms