Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXK8

FBXL12, F-box/LRR-repeat protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL12Q9NXK8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms