Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms