Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms