Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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