Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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