Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHST12Q9NRB3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms