Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms